[Offre de thèse] Doctorat sur la surveillance de la santé des récifs coralliens en combinant l’ADN environnemental (eDNA) avec des marqueurs épigénétiques (H/F)

Ce projet de doctorat vise à développer un outil de biosurveillance innovant pour évaluer l’état de santé des récifs coralliens en couplant l’ADN environnemental (eDNA) et des marqueurs épigénétiques chez les holothuries, avec un focus sur l’espèce Stichopus chloronotus dans le sud-ouest de l’océan Indien.
Les écosystèmes récifaux fournissent des services écosystémiques essentiels — protection côtière, cycle biogéochimique des nutriments, soutien aux pêcheries et réservoirs de biodiversité — mais subissent des pressions anthropiques et climatiques croissantes (réchauffement, acidification, pollution, urbanisation littorale). Face à ces menaces, le développement d’outils de surveillance standardisés, non invasifs et scalables constitue une priorité pour les programmes de gestion et de conservation tels que le PEPR BRIDGES.