Le 21 mai à Paris (Jussieu)
Abstract:

Les macroalgues sont des éléments essentiels des écosystèmes marins y compris des récifs coralliens, particulièrement concernés par les changements globaux. La conservation de la biodiversité représente un enjeu majeur dans ces milieux et c’est dans ce contexte que cette étude s’est intéressée à deux familles d’algues vertes, Udoteaceae et Rhipiliaceae, caractéristiques des flores marines tropicales mais paradoxalement peu étudiées. Les données génétiques disponibles ont révélé de nombreux conflits taxonomiques et des phylogénies mal résolues. Cette étude vise, dans un premier temps, à analyser la diversité spécifique en combinant des données génétiques (tufA, rbcL et 18S rDNA), morphologiques et géographiques, et par le biais de méthodes de délimitation d’espèces et de reconstructions phylogénétiques. Par cette approche intégrative, une révision du statut taxonomique des genres et des familles est proposée. Dans un second temps, cette étude s’est intéressée à la diversification et à la biogéographie des deux familles ainsi qu’à l’évolution phénotypique de la famille Udoteaceae par l’inférence de traits morphologiques sur la phylogénie.

Pour la famille Udoteaceae, 43 espèces ont été étudiées en phylogénie, dont 13 nouvelles espèces et cinq dont l’assignation devra être validée. Les genres Udotea, Rhipidosiphon et Chlorodesmis ont été révisés, les nouveaux genres Glaukea, Ventalia et Rhipidotea sont proposés et le genre Rhipidodesmis reconsidéré. Les genres Tydemania et Flabellia sont conservés tandis que le statut des genres Poropsis, Penicillus et Rhipocephalus est encore à élucider. Pour la famille Rhipiliaceae sensu largo, 45 espèces ont été étudiées, dont 27 sont nouvelles pour la science et quatre dont l’assignation est à confirmer. La famille Rhipiliaceae sensu stricto a été redéfinie autour du genre Rhipilia révisé. Le genre Rhipiliopsis est exclu de la famille et forme une lignée à part entière avec Callypsigma et le nouveau genre proposé Rhipiliospina.

Les Udoteaceae sont apparues durant le Trias supérieur dans la Mer de Téthys et sont caractérisées par trois centres de diversité. La famille Rhipiliaceae est apparue durant le Crétacé inférieur dans l’actuel Indo-Pacifique central (inclus dans la Mer de Téthys à l’époque) et qui est resté son centre de diversité. Enfin, l’inférence des traits morphologiques pour la famille Udoteaceae réactualise le statut des caractères habituellement utilisés dans la diagnose de ces genres. Bien que de nombreuses symplésiomorphies et synapomorphies aient été révélées et jugées pertinentes dans un contexte de révision taxonomique, de nombreux autres caractères se sont avérés homoplastiques et témoignent d’une histoire évolutive des Udoteaceae marquées par de nombreuses évolutions parallèles.

Mots clés :

taxonomie intégrative, phylogénie, délimitation d’espèces, biogéographie, diversification, histoire évolutive, macroalgues, Chlorophyceae, Indo-Pacifique

Jury :

DESTOMBE Christophe Professeur, UPMC Examinateur

DURAND Jean-Dominique Directeur de Recherche, IRD Rapporteur

LELIAERT Frédérik Directeur scientifique Rapporteur

MEINESZ AlexandreProfesseur Émérite, Université Nice Examinateur

Sophia Antipolis/Université Côte d'Azur

PAYRI Claude Directrice de recherche, IRD Directrice de thèse

PUILLANDRE Nicolas Maitre de conférenes, MNHN Examinateur

ZUBIA Mayalen Maitre de conférences, UPFCo-encadrante